Athénaïs Vaginay (GREYC, Caen)

Abstract: Boolean automata networks are used as discrete models of biological systems. They consist of a generalization of cellular automata, where the grid is replaced by a directed graph, and each node has its own transition function. Automata change status over time, according to a chosen update mode, for example: synchronous, asynchronous, general-asynchronous, and the recently introduced “most-permissive” mode.

In this presentation, we will review those modes and see what they allow (or do not allow) to capture about the dynamics of the underlying biological system.

Résumé : Les réseaux d’automates Booléens sont utilisés pour modéliser des systèmes biologiques de manière discrète. Ils consistent en une généralisation des automates cellulaires, où la grille est remplacée par un graphe dirigé, et chaque nœud a sa propre fonction de transition. Le status des automates évolue dans le temps et plusieurs mode de mise à jour peuvent être utilisés, par exemple : synchrone, asynchrone, asynchrone général et, introduit récemment, le “plus-permissif”.

Dans cette présentation, nous allons les passer en revue, et voir ce qu’ils permettent (ou non) de capturer de la dynamique du système biologique sous-jacent.Résumé à venir.